Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Nhlrc3Q8CCH2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
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Nhlrc3Q8CCH2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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