Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Ighm-202ENSMUST00000177715 1698 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ssuh2Q8C3L1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms