Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Ubash3bQ8BGG7 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ubash3bQ8BGG7 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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