Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnupnQ80W37 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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