Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Vtcn1Q7TSP5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vtcn1Q7TSP5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vtcn1Q7TSP5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Vtcn1Q7TSP5 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vtcn1Q7TSP5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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