Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trak1Q6PD31 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trak1Q6PD31 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms