Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp48Q3V0C5 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp48Q3V0C5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp48Q3V0C5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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