Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kdm5aQ3UXZ9 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kdm5aQ3UXZ9 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Kdm5aQ3UXZ9 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Kdm5aQ3UXZ9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14153-201ENSMUST00000119923 1139 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kdm5aQ3UXZ9 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms