Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm28047Q3US59 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm28047Q3US59 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm28047Q3US59 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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