Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Olfr55-202ENSMUST00000214888 4675 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U6N9 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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