Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Traf3ip1Q149C2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms