Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Siah1bQ06985 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms