Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm33263-201ENSMUST00000220371 459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm43049-201ENSMUST00000198099 462 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Nbdy-206ENSMUST00000208373 1061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox12Q04890 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms