Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Polr2cP97760 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms