Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SbdsP70122 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SbdsP70122 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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