Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nphp4P59240 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nphp4P59240 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms