Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa8P50706 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Defa8P50706 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms