Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm42589-201ENSMUST00000199097 1751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Srsf5-204ENSMUST00000110354 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm36595-201ENSMUST00000218830 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zfp410-208ENSMUST00000222258 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Mir5114-201ENSMUST00000175574 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Chd1P40201 Ptprr-207ENSMUST00000155606 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm16304-201ENSMUST00000129972 775 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Esd-201ENSMUST00000022573 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm25687-201ENSMUST00000175442 241 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Kcne3-204ENSMUST00000179842 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm29372-201ENSMUST00000191416 364 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm38153-201ENSMUST00000195484 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gm29961-202ENSMUST00000215431 637 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 AC154669.1-201ENSMUST00000224405 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chd1P40201 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms