Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxc11P31313 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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