Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RxrgP28705 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RxrgP28705 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxrgP28705 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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