Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RxraP28700 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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RxraP28700 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RxraP28700 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RxraP28700 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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