Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tgfb1P04202 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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