Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Pfkfb3-215ENSMUST00000183869 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Zfp572-201ENSMUST00000183674 1098 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 1110017D15Rik-202ENSMUST00000095126 884 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rpl21-ps2-201ENSMUST00000222933 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 AC129590.1-201ENSMUST00000225573 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm25723-201ENSMUST00000104530 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm35299-201ENSMUST00000195865 421 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm26205-201ENSMUST00000082907 134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Fcrla-203ENSMUST00000159171 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc8E9PWG2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms