Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssxb8B1AY40 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssxb8B1AY40 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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