Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc183A2AJB1 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms