Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm3550W4VSN7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms