Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac5Q9Z2V6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms