Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sema6cQ9WTM3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sema6cQ9WTM3 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms