Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pop5Q9DB28 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pop5Q9DB28 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pop5Q9DB28 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pop5Q9DB28 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pop5Q9DB28 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pop5Q9DB28 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pop5Q9DB28 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Pop5Q9DB28 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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