Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Nop56Q9D6Z1 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nop56Q9D6Z1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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