Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Rnf144aQ925F3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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