Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SrrdQ8K2M3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SrrdQ8K2M3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms