Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc12Q8K2L8 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms