Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc17Q8CE13 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms