Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cwc22Q8C5N3 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cwc22Q8C5N3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms