Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm2Q8BGA3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms