Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnupnQ80W37 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms