Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Clcn1Q64347 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms