Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms