Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cxcr4P70658 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms