Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Hoxd13P70217 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd13P70217 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms