Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
NapbP28663 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NapbP28663 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NapbP28663 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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