Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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