Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pou3f1P21952 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms