Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
P18530 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
P18530 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
P18530 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms