Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Gm37842-201ENSMUST00000192330 1569 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx8O35652 Tmod2-203ENSMUST00000164100 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lhx8O35652 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms