Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc1a6O35544 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc1a6O35544 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Slc1a6O35544 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Slc1a6O35544 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc1a6O35544 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms