Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm3371F7CQW8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms