Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChmQ9QXG2 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms