Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Smg9Q9DB90 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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